Вместо предполагавшейся каменной двухэтажной церкви, за недостатком средств, была построена каменная одноэтажная, одноглавая церковь, с деревянной шатровой колокольней и освящена во имя Николая Чудотворца в 1750 году. В 1765 году, по описи 1769 г., во всех церквах, т. е. в новой каменной и старой деревянной Воскресенской, все иконы были поновлены. В 1772 году вследствие прошения причта и прихожан благославляющей грамотою преосвященного Иоанна, епископа Великоустюжского и Тотемского, было разрешено вместо деревянной церкви в честь Воскресения Христова с приделом во имя великомученицы Парасковии, пришедшей в крайнюю ветхость, построить каменную в то же наименование над теплою каменною, что во имя святителя Николая, с каменным приделом к нижней церкви во имя Парасковии Пятницы147. В грамоте, по-видимому, допущена ошибка. При Воскресенской церкви не было придела во имя влмцы. Парасковии. В том же 1772 году, вследствие второго прошения прихожан, указом от 19 марта разрешено над папертью теплой Николаевской церкви построить каменную колокольню. На самом деле, должно быть за недостатком средств, выстроили только верхний этаж да колокольню, а придел не построили. В 1775 году новопостроенный храм в верхнем этаже был освящен в честь Воскресения Христова148.
С 1775 г. и по настоящее время каменная церковь не раз подвергалась существенным переделкам. Особенно много переделок произведено с 1820 г. по 1880 г. бывшими владельцами солеваренного завода М. И. и А. М. Кокаревыми. Из них отметим главные. В 1803 г. церковь была покрыта железной кровлей. В 1847 г. сделан новый шпиль на колокольне и кресты на церковных главах. В 1848-1854 гг. в верхнем этаже выбраны излишния связи и стена, отделявшая среднюю часть храма от трапезы, сделана арка149. В то же время, если не ошибаемся, были перестроены колокольня и вход в верхний и нижний этажи. В 1872 году в Никольском храме вновь переделан иконостас и написаны иконы: Воскресения Христова, Божией Матери "Утоли моя печали" и другие. В 1876-1877 гг. в верхнем храме подновлен иконостас. В 1880 г. разрешено исправить крышу на храме и стены отбелить150.
Неодновременная постройка этажей, ремонт и переделки в разное время - все это и сказалось на архитектуре здания Варницкой Воскресенской церкви. Верхний этаж с четвериком, увенченным пятью ампирными главками, возвышающимися над этажом на целый ярус, построен в стиле барокко и в общем напоминает Входо-Иерусалимскую церковь Предтечеиского прихода. Внутри средняя часть храма соединена с трапезой аркой почти во всю ширину здания. По бокам этой арки торчат концы вырубленных излишних связей. Благодаря вырубленным связям в стенах верхнего этажа появились трещины над вершиной арки и в перемычках окон. Видно, что трещины время от времени заделываются штукатуркой, но с течением времени снова появляются. Следовало бы исследовать трещины и произвести основательный ремонт. Существующая колокольня восьмиугольная, по ребрам украшена полуколонками. При перестройке, по словам бывшего заведующего работами у Кокаревых Н. Гр. Дедохина, ныне уже покойного, колокольня значительно была увеличена в высоту. Чтобы придать ей устойчивое положение, нижний этаж бывшей колокольни укрепили: в бывшей паперти нижней церкви вновь сложили две стены параллельно с боковыми, северной и южной, а вход, бывший прежде с западной стороны, заложили и снаружи, против него, устроили контрфорс. Часть старого наличника, украшавшего когда-то входную арку, и теперь виднеется над контрфорсом. Вход в нижнюю церковь устроили с северной стороны, а так как на этом месте был вход (крыльцо) в верхний храм, то его сломали и вновь устроили уже из паперти нижней церкви. В верхнем этаже с северной стороны и в настоящее время виден наличник как бы от входной арки. Нижний этаж здания по наружным украшениям сходен с корпусом Ильинской церкви Предтеченского прихода: такие же кокошники над окнами и такие же пилястры.